Contexte du stage

La longévité des chèvres laitières dépend en grande partie des caractéristiques mammaires (état de santé et capacité de production de lait). Un moyen de caractériser la mamelle des chèvres est de suivre son évolution morphologique, et l’intégrité de son tissu. Aujourd’hui l’évaluation morphologique des mamelles est réalisée visuellement par des techniciens qualifiés, méthode efficace mais chronophage. Les récents progrès de l'imagerie 3D permettent de reconstruire la géométrie de la mamelle, et pourrait être un moyen de suivre l’évolution du tissu mammaire au cours d’une lactation. Il est également possible de suivre l’intégrité du tissu mammaire par des mesures effectuées dans le lait (telles que l’exfoliation des cellules épithéliales mammaires dans le lait, les minéraux Na+ et le K+, les teneurs en protéines (caséines versus protéines sériques)). Ces analyses sur le lait en complément de scans 3D de la mamelle pourraient constituer un bon indicateur de la longévité mammaire.

Le stage vise à étudier de manière non invasive l’évolution du tissu mammaire par analyse de la morphologie 3D de la mamelle et des analyses du lait au cours de la lactation chez la chèvre pour, in fine, évaluer la longévité mammaire. Le projet s’appuiera sur une expérimentation du projet CapriMamIA (Morphologie et longévité mammaire des chèvres à l’aide de l’imagerie 3D et l’intelligence artificielle) menée à l’IEPL (mars 2026 - juillet 2027), qui combine :

• Un suivi longitudinal de 60 chèvres au cours de 2 lactations (scan 3D), avec des mesures d’intégrité du tissu mammaire sur 12 d’entre elles ;
• étude de l'impact du remplissage de la mamelle entre deux traites sur la morphologie des mamelles sur 10 chèvres à 3 temps de la lactation (scan 3D).

Missions

Le/la stagiaire sera intégré·e à l’équipe de recherche INRAE et sera aussi co-encadré·e par la coordinatrice du projet CapriMamIA (Idele). Il/Elle participera à plusieurs volets : volet terrain à la ferme et volet laboratoire (analyses biochimiques et analyses cellulaires et moléculaires) pour réaliser les missions suivantes :

• Mesures des scans 3D à l’IEPL et analyses d’image 3D pour détermination du volume de tissu.
• Collecte des échantillons de lait à l’IEPL.
• Préparation de cellules à partir du lait et analyse des cellules par cytométrie en flux (détermination de l’exfoliation des cellules épithéliales mammaires dans le lait).
• Analyse de l’expression des gènes (gènes impliqués dans la synthèse du lait) des cellules du lait par PCR.
• Analyse des données de performances laitières (lait et composition du lait), de la morphologie mammaire, et de l’intégrité de l’épithélium mammaire.
• Présentation des résultats aux membres du projet CapriMamIA

Compétences développées

• Utilisation d’outils innovants (analyse d’images 3D).
• Traitement et valorisation statistique de données expérimentales.

Profil, niveau souhaité

• Dernière année de formation supérieure : universitaire, élève ingénieur agronome, étudiant vétérinaire.
• Connaissances : biologie animale dont physiologie de la lactation, zootechnie, notion de biologie cellulaire et moléculaire.
• Compétences opérationnelles : organisation et compétence en analyse de laboratoire, analyses statistiques, logiciel R.
• Langues : français, anglais.
• Permis de conduire 

Encadrement et personne à contacter

UMR Pegase, équipe BIOlogie des FONctions pour la Transition des Elevages : Marion Boutinaud (marion.boutinaud[at]inrae.fr  02 23 48 50 81) avec un co-encadrement avec Alice Rousseau (alice.rousseau[at]idele.fr).
 

Conditions d’accueil

• Indemnisation de stage environ 650 €/ mois.
• Logement : néant.
• Restauration : Restaurant d’entreprise INRAE sur St Gilles.
• Transport : ligne de bus Rennes-St Gilles.
• Dates du stage : début février ou début mars pour 6 mois.