Contexte

Les objectifs de l’amélioration génétique doivent évoluer pour répondre aux enjeux d’un développement durable des productions animales face à un contexte environnemental et sociétal changeant. La résilience et la longévité des animaux en plus de leur potentiel de production sont ainsi des éléments clés à considérer.

Missions

Nos missions consistent à identifier et à optimiser des stratégies d’amélioration génétique innovantes pour favoriser et accroître la multi-performance (production et longévité) des poules pondeuses, permettant le développement de systèmes d’élevage plus résilients face à différents aléas, en phase avec la demande sociétale et la transition agroécologique. Cela implique une très forte évolution des questions et des méthodes de recherche, avec la prise en compte de données complexes et hétérogènes relatives à l’animal (allant de son génome à son comportement) et à son environnement d’élevage (climat, situation géographique…).

Axes de recherche

Nos recherches s’inscrivent dans trois axes :

• L’analyse du déterminisme génétique de caractères importants à améliorer pour répondre aux enjeux de la transition agroécologique via des programmes de sélection de poules pondeuses : flexibilité des réserves énergétiques et calciques (composantes génétiques et épigénétiques) ; comportements de ponte ; compromis entre bien-être, santé et production.
• L’intégration d’informations de structure et de fonction à l’échelle du génome : étude de polymorphismes candidats impliqués dans des caractères d’intérêt ; caractérisation de traces de sélection spécifiques dans les filières chair, ponte et dans des races locales ; annotation du génome de la poule, notamment par l’identification de nouveaux variants et ARN régulateurs longs non codants.
• Contribution à l’optimisation ou à la conception de programmes de sélection en considérant l’inclusion de « nouveaux » caractères, et l’utilisation d’informations génomiques issues de nos travaux de recherches.

Expertises et compétences

Pour mener à bien nos différents travaux de recherche, l’équipe dispose d’expertises reconnues, reposant sur des compétences larges et complémentaires en zootechnie (mesures de caractères, prélèvements tissulaires), en modélisation et génétique quantitative (analyses de paramètres génétiques, GWAS et QTL), en génomique, statistiques et bioinformatique (annotation du génome, génotypages, séquençages et analyses de données) et en biologie moléculaire et cellulaire (caractérisation de gènes, analyses de la régulation de leur expression et de leurs fonctions).

Responsable d'équipe

Christian Diot
Tél. : 02 23 48 54 61
Courriel : Christian Diot

Membres de l'équipe